集装箱码头的空箱操作主要分空箱进、出场操作和空箱管理两部分。
一、 空箱进场操作。 码头空箱进场有两种方式，空箱卸船进场和空箱通过检查口进场。空箱卸船进场前，码头堆场计划员必须安排空箱堆存计划。该计划安排的原则为，空箱根据箱尺码的不同，箱型的不同，按不同的持箱人分开堆存，码头与船方必须在卸箱时办理设备交接单手续。
通过检查口进场的空箱主要有两种，一种为船公司指定的用于出口装船的空箱，一种为进口重箱拆箱后返回码头。
如为船公司指定用箱，则根据堆场计划员所作堆存计划与不同的尺码，不同的箱型，按出口船名、航次堆放;如为进口箱拆箱后返回码头堆��，则根据堆场计划员所作堆存计划与持箱人的不同，分开堆放。空箱进检查口时，码头检查口与承运人必须办理交单手续。
二、 空箱出场操作。 码头空箱出场主要有两种方式，空箱装船出场和空箱通过检查口出场。
装船出场的空箱主要有两种， 一种为船公司指定用于出口装船的空箱，另一种为装驳船的空箱。码头箱务管理员应根据代理出具的工作联系单、空箱装船清单或船公司提供的出口装船用箱指令，安排装船用箱计划。
码头配载计划员根据箱务管理员的用箱计划以及代理提供的场站收据，结合船名、航次的配载情况，选择全部计划空箱或部分计划空箱配船。凡该船航次未能装船的空箱，箱务管理员应做好记录，以备下一航次装船之用。
(1)门到门提空箱，主要是出口载货用空箱的提运。该空箱提运至集装箱点进行装箱后，重箱即回运本码头准备装船出口。空箱门/门提离港区，货主或内陆承运人应向集装箱代 理人提出书面申请。
集装箱代理人根据出口集装箱预配清单向货主或内陆承运人签发出场集装箱设备交接单和进场集装箱设备交接单。货主或内陆承运人凭出场集装箱设备交接单向码头堆场提取空箱。
(2)单提空箱，是指将空箱提运至码头外的集装箱堆场(CY)。如船公司提空箱至港外堆��，提退租箱等。码头箱务管理员应根据船公司或其代理的空箱提运联系单发箱，联系单上一般应写明持箱人、承运车队、流向堆场等，并注明费用的结算方法。
(3)因检验、修理、清洗、薰蒸、转运等原因需向码头提空箱。货代或内陆承运人应向集装箱代理人提出书面申请，集装箱代理人根据委托关系或有关协议向货方或内陆承运人签发出场集装箱设备交接单和进场集装箱设备交接单。
货方或内陆承运人凭出场集装箱设备交接单向码头堆场提取空箱，码头凭代理的工作联系单发箱。 空箱出场时，码头应与船方或承运人做好集装箱设备交接单和交接手续。
三、 堆场空箱管理。 码头堆场存放空箱的基本堆放原则，是按持箱人和箱尺寸的不同分开堆放。码头设有专用的空箱堆存箱区，一般可堆放4至5层空箱。当码头内发生拆箱作业后，拆空的箱应及时归并，并按堆垛要求堆放。